实验基本信息
实验编号 CRX038434
物种名称 Plutella xylostella
标题 adult_f
项目编号 PRJCA001194
样本编号 SAMC053455
测序平台 Illumina HiSeq X Ten
建库信息
文库名称 文库构建方法 建库策略 样品来源 实验选择 文库布局
Total RNA from these 10 samples (eggs, 1st larvae, 2nd larvae, 3rd larvae, 4th male larvae, 4th female larvae, male pupae, female pupae, male adults, female adults) were grinded in TRIzol regent on the dry ice, and then processed following the protocol of RNAeasy Mini Kit (manufacturer: Qiagen). To remove DNA, total RNA was treated with DNaseI (manufacturer: Qiagen). We used the Agilent 2100 with an RNA Integrity Number (RIN) value to assess the total RNA quality. RNA samples with RIN > 8 were used for following analyses. RNA-seq libraries were constructed using 20 µg total RNA from all samples (2 µg for each sample) following the protocol from ScriptSeq kit. Finally, Illumina HiSeq 2500 platform was used to generate the PE (Paired-end) reads. RNA-Seq TRANSCRIPTOMIC PolyA PAIRED
处理信息 Planned read length (bp) for mate 1: 151
Planned read length (bp) for mate 2: 151
Insert size (bp): 400
发布日期2019-01-20
测序反应
Run编号 发布日期 Run序列文件信息
File nameFile size (MB)
CRR043105 2019-01-20 adult_f_R1.fastq.gz
adult_f_R2.fastq.gz
2,727.15
3,224.59
提交lin jing (lolyemily@163.com)
所属单位Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences
提交日期2019-01-10